NGS样本实验流转

最后更新于：2023-09-01 15:26:14

NGS实验流转

添加/导入样本

路径：样本——样本管理

PC端或手机端添加‘NGS’项目的样本，这里以PC为例。

样本接收

路径: 接收一一样本接收

样本模块中样本接收管理，点击添加样本接收对已采样的NGS项目订单进行接收。

添加的时候，根据订单条形码或快递单号等扫码查询；接收列表这时候可以对其进行编码记录，样本质检等操作，完成之后保存信息。

样本接收列表

路径: 接收一一样本接收列表

打印流转单

样本质检合格添加完之后，收录到接收列表；选择该样本打印流转单，对其流转线上线下确认接收无误。

打印的效果如下图。

开启实验流

确认接收后，选择该样本点击开启实验流，正式进入我们的NGS实验流程检测啦。

NGS实验流程

实验流程汇总

路径: 实验一一实验流程汇总

点击实验模块中，流程汇总列表，实时跟进流程进度是否有异常以及统计数量；列表中点击数字可以直接跳转到该流程进处理。

病理分析

路径: 实验——肿瘤NGS一一病理分析

找到实验模块中病例分析点击添加开启第一个实验流程。

待选列表选择编码记录过的样本，配置实验人员，添加到右侧列表中。

实验检测完后点击实验结果，记录该流程结果以及审核是否合格。

记录如肿瘤细胞含量参数的数值，根据实验质控标准评定结果，并提示下一实验流程。

核酸提取DNA

路径: 实验——肿瘤NGS一一核酸提取DNA管理

病例分析结束后，同理在实验模块找到核酸提取DNA点击添加开启DNA提取。

左侧列表出现熟悉的样本信息以及上步实验流程信息，配置实验人员点击添加到右侧列表中。

右侧列表对样本信息以及实验信息查看；实验检测完后点击实验结果进行DNA结果录入审核。

记录DNA提取中的参数以及其数值，根据实验质控标准评定结果，并提示下一实验流程。

文库构建

路径: 实验——肿瘤NGS一一文库构建管理

DNA提取结果录入分析后，进入NGS文库构建实验；同样找到对应的实验进行添加开启；添加时配置实验人员，添加到右侧实验列表中。

查看样本信息以及DNA提取实验信息；文库构建实验检测完后点击实验结果进行结果录入审核。

批量导入或手动记录文库构建中的参数以及其数值，根据实验质控标准评定结果，并提示下一实验流程，提交保存。

杂交捕获

路径: 实验——肿瘤NGS一一杂交捕获2管理

NGS文库构建结果录入分析后，对应模块点击添加开启NGS杂交捕获实验；添加时配置实验人员，添加到右侧实验列表中。

杂交捕获实验检测完后点击实验结果进行结果录入审核。

同理记录杂交捕获中的参数以及其数值，根据实验质控标准评定结果，并提示下一实验流程，提交保存。

上机测序

路径: 实验——肿瘤NGS一一NGS测序1管理

NGS杂交捕获结果录入分析后，对应模块点击添加开启上机测序；添加时配置实验人员，添加到右侧实验列表中。

上机测序实验检测完后点击实验结果进行结果录入审核。

同理记录上机测序中的参数以及其数值，根据实验质控标准评定结果，并提示下一实验流程，提交保存。

NGS数据分析

路径: 实验——肿瘤NGS一一NGS数据分析管理

上机测序实验结束后，找到NGS数据分析点击添加开启数据分析；添加时配置实验人员，添加到右侧实验列表中。

数据分析实验检测完后点击实验结果进行结果录入审核。

同理记录数据分析中的参数以及其数值，根据实验质控标准评定结果，并提示NGS实验流程已完成，提交保存。

异常处理

实验前异常(样本质检不合格)

除了上文正常走通实验之外，当然也会出现实验异常；当样本录入后，质检发现样本异常后会被作为异常样本处理，如样本血液未达标等问题。

异常样本接收后，该样本重新补样处理再进入正常流程，其他影响对该订单终止检测；并备注详细情况。

实验中异常（实验分析结果不合格）

实验流程中，根据质控标准评定是否合格，当参数数值结果不达标，结果为不合格时，会被记录到该实验异常结果列表中。

不合格的实验结果不处理，进度会一直停留在该流程中。

如病例分析结果不合格时，进入病例分析异常结果列表；选择继续原流程、终止或者重新选择下一实验流程处理该结果。

处理完后，该样本按照修改后进行实验。