NGS样本实验流转

最后更新于:2024-01-26 11:07:43

NGS实验流转

添加/导入样本

路径:样本——样本管理

PC端或手机端添加‘NGS’项目的样本,这里以PC为例。

 

样本批量接收

路径: 接收一一样本批量接收列表

样本接收

添加的时候,根据订单条形码或快递单号等扫码查询;接收列表这时候可以对其进行编码记录,样本质检等操作,也可批量查询样本信息,完成之后保存信息。

样本流转

找到刚接收的实验单号,选中样本,保存新增

流转单打印

开启工作流,可打印流转单,查看样本下一步操作流程

 

打印的效果如下图。

 

NGS实验流程

实验流程汇总
路径: 实验一一实验流程汇总

点击实验模块中,流程汇总列表,实时跟进流程进度是否有异常以及统计数量;列表中点击数字可以直接跳转到该流程进处理。

 

病理分析
路径: 实验——肿瘤NGS一一病理分析

找到实验模块中病例分析点击添加开启第一个实验流程。

待选列表选择编码记录过的样本,配置实验人员,添加到右侧列表中。

实验检测完后点击实验结果,记录该流程结果以及审核是否合格。

记录如肿瘤细胞含量参数的数值,根据实验质控标准评定结果,并提示下一实验流程。

 

核酸提取DNA
路径: 实验——肿瘤NGS一一核酸提取DNA管理

病例分析结束后,同理在实验模块找到核酸提取DNA点击添加开启DNA提取。

左侧列表出现熟悉的样本信息以及上步实验流程信息,配置实验人员点击添加到右侧列表中。

右侧列表对样本信息以及实验信息查看;实验检测完后点击实验结果进行DNA结果录入审核。

记录DNA提取中的参数以及其数值,根据实验质控标准评定结果,并提示下一实验流程。

 

文库构建
路径: 实验——肿瘤NGS一一文库构建管理

DNA提取结果录入分析后,进入NGS文库构建实验;同样找到对应的实验进行添加开启;添加时配置实验人员,添加到右侧实验列表中。

查看样本信息以及DNA提取实验信息;文库构建实验检测完后点击实验结果进行结果录入审核。

批量导入或手动记录文库构建中的参数以及其数值,根据实验质控标准评定结果,并提示下一实验流程,提交保存。

 

杂交捕获
路径: 实验——肿瘤NGS一一杂交捕获2管理

NGS文库构建结果录入分析后,对应模块点击添加开启NGS杂交捕获实验;添加时配置实验人员,添加到右侧实验列表中。

杂交捕获实验检测完后点击实验结果进行结果录入审核。

同理记录杂交捕获中的参数以及其数值,根据实验质控标准评定结果,并提示下一实验流程,提交保存。

 

上机测序
路径: 实验——肿瘤NGS一一NGS测序1管理

NGS杂交捕获结果录入分析后,对应模块点击添加开启上机测序;添加时配置实验人员,添加到右侧实验列表中。

上机测序实验检测完后点击实验结果进行结果录入审核。

同理记录上机测序中的参数以及其数值,根据实验质控标准评定结果,并提示下一实验流程,提交保存。

 

NGS数据分析
路径: 实验——肿瘤NGS一一NGS数据分析管理

上机测序实验结束后,找到NGS数据分析点击添加开启数据分析;添加时配置实验人员,添加到右侧实验列表中。

数据分析实验检测完后点击实验结果进行结果录入审核。

同理记录数据分析中的参数以及其数值,根据实验质控标准评定结果,并提示NGS实验流程已完成,提交保存。

 

异常处理

实验前异常(样本质检不合格)

除了上文正常走通实验之外,当然也会出现实验异常;当样本录入后,质检发现样本异常后会被作为异常样本处理,如样本血液未达标等问题。

异常样本接收后,该样本重新补样处理再进入正常流程,其他影响对该订单终止检测;并备注详细情况。

实验中异常(实验分析结果不合格)

实验流程中,根据质控标准评定是否合格,当参数数值结果不达标,结果为不合格时,会被记录到该实验异常结果列表中。

不合格的实验结果不处理,进度会一直停留在该流程中。

如病例分析结果不合格时,进入病例分析异常结果列表;选择继续原流程、终止或者重新选择下一实验流程处理该结果。

处理完后,该样本按照修改后进行实验。